Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms