Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms