Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms