Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms