Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KANK3Q6NY19 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms