Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIRMAQ69YN4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms