Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNS3Q68CZ2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms