Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP350Q5VT06 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms