Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms