Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms