Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF8Q3BBV2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF8Q3BBV2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms