Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NBPF1Q3BBV0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NBPF1Q3BBV0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms