Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFSDQ2M296 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFSDQ2M296 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms