Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM187BQ17R55 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms