Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LTC4SQ16873 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTC4SQ16873 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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