Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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