Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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