Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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