Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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