Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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