Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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