Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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