Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A1Q15459 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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