Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR6A1Q15406 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms