Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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