Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms