Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
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