Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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