Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
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