Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms