Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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CHD4Q14839 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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