Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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