Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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