Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKG1Q13976 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKG1Q13976 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKG1Q13976 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKG1Q13976 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKG1Q13976 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms