Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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