Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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