Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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