Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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