Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTK7Q13308 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms