Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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