Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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