Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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