Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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