Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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