Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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