Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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