Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GALNT1Q10472 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALNT1Q10472 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms