Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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