Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms