Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms